Ottawa, Gatra.com - Sebelum coronavirus baru, SARS-CoV-2 membuat lompatan ke manusia, dua coronavirus lain, SARS-CoV dan MERS-CoV, berevolusi dalam kelelawar dan melewati hewan lain dalam perjalanan mereka menuju manusia. SARS-CoV melewati musang dan MERS-CoV melalui unta. Struktur molekul SARS-CoV-2 juga menunjukkan bahwa virus itu melewati hewan peralihan, tetapi para ilmuwan belum tahu yang mana. Livescience.com, 15/04.
Pada Februari, penulis studi pendahuluan yang diterbitkan ke database preprint bioRxiv menyarankan bahwa trenggiling dapat menjembatani kesenjangan antara kelelawar dan manusia. Karena SARS-CoV-2 dan coronavirus terkait yang menginfeksi trenggiling menggunakan protein lonjakan serupa - sebuah struktur pada permukaan virus yang memungkinkannya menginfeksi sel. Tetapi para ilmuwan lain berpendapat bahwa, terlepas dari protein lonjakan mereka, virus corona trenggiling memiliki banyak perbedaan dengan SARS-CoV-2 yang membuat trenggiling tidak mungkin menjadi sumber infeksi, The New York Times melaporkan.
Dengan misteri yang belum terselesaikan, profesor biologi Xuhua Xia dari Universitas Ottawa di Kanada meluncurkan penyelidikannya sendiri tentang bagaimana virus corona berpindah dari kelelawar ke manusia. Analisisnya, yang diterbitkan 14 April dalam jurnal Molecular Biology and Evolution, menawarkan solusi baru: anjing!
Xia mencapai kesimpulannya dengan memindai kode genetik SARS-CoV-2 dan coronavirus lainnya untuk fitur spesifik yang dikenal sebagai situs CpG, urutan kode genetik di mana senyawa sitosin (C) diikuti senyawa guanine (G). Sistem kekebalan manusia melihat situs CpG sebagai bendera merah, menandakan bahwa ada virus invasif. Sebuah protein manusia yang disebut zinc finger antiviral protein (ZAP) menempel pada situs CpG pada kode genetik virus dan merekrut bantuan untuk memecah patogen, menurut UniProt, database protein online. Teorinya mengikuti bahwa, semakin sedikit situs CpG, virus akan semakin rentan terhadap ZAP.
Xia menemukan bahwa SARS-CoV-2 membawa lebih sedikit situs CpG daripada coronavirus lainnya yang diketahui pertama kali berevolusi pada hewan, termasuk SARS-CoV dan MERS-CoV. Selain itu, kerabat terdekat yang diketahui dari SARS-CoV-2, kelopak koronavirus RaTG13, mengandung lebih sedikit situs CpG dibandingkan Coronavirus kelelawar. "Ini menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 mungkin telah berevolusi di inang baru (atau jaringan inang baru) dengan ekspresi ZAP tinggi," yang akan menempatkan tekanan evolusioner pada virus untuk melepaskan situs CpG, tulis Xia.
Pada dasarnya, untuk bertahan hidup dan bereproduksi, patogen seperti SARS-CoV-2 harus dapat menghindari kekebalan inang, dan dalam hal ini berarti menyingkirkan situs CpG yang dapat mengingatkan protein ZAP terhadap virus.
Sayangnya, hanya ada sedikit data tentang berapa banyak ZAP muncul di jaringan hewan yang berbeda, kata Xia kepada Live Science. Jadi dia bekerja mundur, mencari coronavirus hewan dengan kadar CpG yang rendah. Dia menemukan virus corona yang terutama menginfeksi usus anjing, dan dengan demikian menyimpulkan bahwa usus anjing mungkin mengandung tingkat ZAP yang memadai untuk mendorong evolusi virus dengan cara ini.
"Hanya anjing yang tampaknya memiliki jaringan yang menghasilkan CoV CpG rendah selama penelitian saya," kata Xia. Jika prekursor SARS-CoV-2 melanggar usus anjing, maka ini akan "mengakibatkan evolusi cepat virus" kehilangan situs CpG dan menjadi lebih siap untuk menginfeksi manusia, tulisnya. Di luar tingkat CpG yang rendah, makalah itu tidak mencatat kesamaan genetik lainnya antara SARS-CoV-2 dan Coronavirus anjing, tetapi menyarankan bahwa usus anjing mungkin menyediakan lingkungan yang tepat bagi virus tersebut untuk berkembang.
Tapi mengapa usus anjing? Beberapa penelitian menunjukkan bahwa ZAP mRNA, yang berisi instruksi untuk membangun protein, muncul di paru-paru anjing dan usus besar tetapi konsentrasi yang lebih tinggi menumpuk di paru-paru, kata Xia. Mungkin bahwa kekenyangan ZAP di paru-paru menjaga organ dari virus Corona, sedangkan konsentrasi ZAP yang lebih rendah di usus besar membiarkan usus terbuka terhadap infeksi parah, meskipun ada alasan untuk berhati-hati dalam sampai pada kesimpulan ini, kata Xia.
