Pittsburgh, Gatra.com- Virus Corona baru telah mengembangkan sejumlah mutasi yang mengkhawatirkan, yang menghasilkan banyak varian baru bermunculan di seluruh dunia. Sekarang, sebuah studi baru menjelaskan bagaimana virus bermutasi dengan mudah dan mengapa mutasi ini membantunya "melarikan diri" dari respon kekebalan tubuh. Live Science, 05/02.
Para peneliti studi menemukan bahwa SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan COVID-19, sering bermutasi hanya dengan menghapus potongan kecil kode genetiknya. Meskipun virus memiliki mekanisme "proofreading" (cara baca) sendiri yang memperbaiki kesalahan saat virus mereplikasi, penghapusan tidak akan muncul di radar proofreader.
"Ini sangat pintar," kata penulis senior studi Paul Duprex, direktur Center for Vaccine Research di University of Pittsburgh, kepada Live Science. "Anda tidak bisa memperbaiki apa yang tidak ada di sana."
Terlebih lagi, untuk SARS-CoV-2, penghapusan ini sering muncul di titik serupa pada genom, menurut penelitian yang diterbitkan 3 Februari di jurnal Science. Ini adalah situs di mana antibodi orang akan mengikat dan menonaktifkan virus. Tetapi karena penghapusan ini, antibodi tertentu tidak dapat mengenali virus.
Duprex menyamakan penghapusan itu dengan untaian manik-manik di mana satu manik muncul. Itu mungkin tidak tampak seperti masalah besar, tetapi bagi antibodi, ini "sangat berbeda," katanya. "Ketidakhadiran kecil ini memiliki efek yang sangat besar."
Duprex dan rekan-rekannya pertama kali memperhatikan penghapusan ini pada pasien yang terinfeksi virus corona dalam waktu yang sangat lama - 74 hari. Pasien memiliki sistem kekebalan yang lemah, yang mencegah mereka membersihkan virus dengan benar. Selama infeksi yang berkepanjangan, virus korona mulai berkembang saat ia memainkan permainan "kucing dan tikus" dengan sistem kekebalan pasien , yang pada akhirnya mengembangkan penghapusan, kata para peneliti.
Mereka bertanya-tanya seberapa umum penghapusan semacam itu. Mereka menggunakan database yang disebut GISAID untuk menganalisis sekitar 150.000 urutan genetik SARS-CoV-2 yang dikumpulkan dari sampel di seluruh dunia. Dan sebuah pola muncul. "Penghapusan ini mulai berbaris ke situs yang sangat berbeda," kata pemimpin penulis studi Kevin McCarthy, asisten profesor biologi molekuler dan genetika molekuler di University of Pittsburgh.
"Kami terus melihatnya berulang kali," dalam sampel SARS-CoV-2 yang dikumpulkan dari berbagai belahan dunia pada waktu yang berbeda, katanya. Tampaknya strain virus ini secara independen mengembangkan penghapusan ini karena "tekanan selektif yang umum," tulis para peneliti dalam makalah mereka.
Para peneliti menjuluki situs tersebut sebagai "daerah penghapusan berulang." Mereka memperhatikan bahwa daerah-daerah ini cenderung muncul di titik-titik protein lonjakan virus tempat antibodi mengikat untuk menonaktifkan virus. "Itu memberi kami petunjuk pertama bahwa kemungkinan penghapusan ini mengarah pada 'pelarian' atau evolusi [virus] menjauh dari antibodi yang mengikat," kata McCarthy.
Para peneliti memulai proyek mereka pada musim panas 2020, ketika virus corona tidak dianggap bermutasi secara signifikan. Tetapi penghapusan yang muncul di datanya mengatakan sebaliknya. Pada Oktober 2020, mereka menemukan varian dengan penghapusan ini yang kemudian akan dikenal sebagai " varian Inggris ", atau B.1.1.7. Varian ini mendapat perhatian global mulai Desember 2020, ketika menyebar dengan cepat di Inggris Raya.
"Survei kami untuk varian penghapusan menangkap perwakilan pertama dari apa yang akan menjadi garis keturunan B.1.1.7," tulis para penulis. Temuan mereka menggarisbawahi pentingnya memantau evolusi virus dengan melacak penghapusan ini dan mutasi lainnya.
"Kami perlu mengembangkan alatnya, dan kami perlu memperkuat kewaspadaan kami untuk mencari hal-hal ini dan mengikuti mereka ... sehingga kami dapat mulai memprediksi apa yang sedang terjadi," kata McCarthy.
Meskipun virus dapat bermutasi untuk menghindari beberapa antibodi, antibodi lain masih dapat mengikat dan menonaktifkan virus secara efektif.
"Mengejar virus dengan berbagai cara berbeda adalah cara kami mengalahkan pengubah bentuk," kata Duprex dalam sebuah pernyataan . "Kombinasi antibodi yang berbeda [yaitu perawatan antibodi monoklonal yang berbeda] ... berbagai jenis vaksin. Jika ada krisis, kami ingin mendapatkan cadangan itu."
Penemuan ini juga menunjukkan mengapa penting untuk memakai masker dan menerapkan langkah-langkah lain untuk mencegah penyebaran virus - semakin banyak orang yang terinfeksi, semakin besar peluang virus untuk bereplikasi dan berpotensi bermutasi. "Apa pun yang bisa kita lakukan untuk mengurangi jumlah replikasi ... akan memberi kita sedikit waktu," kata Duprex.
